C’est à l’occasion d'un colloque « Crise et Existence », organisé à l’Université de Louvain (Belgique) les 17 et 18 mars 1993, que, sous l’impulsion d’un doctorant, Emmanuel Monod, fut fondée l’École Française de Daseinsanalyse par Jean-Michel Azorin, Françoise Dastur, Emmanuel Monod et Bernard Pachoud.
À la suite d'une première réunion d’information, le 4 novembre 1993, à l’ENS de la rue d’Ulm, il fut décidé d'organiser un séminaire mensuel dont la première séance se déroula le 6 janvier 1994. Depuis cette date, les travaux de l’école n’ont jamais cessé. Désormais, l'École Française de Daseinsanalyse est rattachée aux Archives-Husserl de Paris et son séminaire se tient dans les locaux de l'École Normale Supérieure, rue d'Ulm.
L'école est hébergée par la chaire de philosophie de l'hôpital Sainte-Anne. L'accès au site est ouvert et gratuit.
